Nachdem sie zehn Jahre getrennt gelebt haben, ziehen der Highschool-Schüler Shin Kanzato und sein kleiner Bruder Jun bei ihrem großen Bruder Ryō, Polizeichef von Ayanagi City, ein. Die Stadt wird zu dieser Zeit von mysteriösen Vorfällen erschüttert, wie das unerklärliche Verschwinden der Crew eines U-Bootes, das erneute Auftreten des Apathie-Syndroms nach 10 Jahren, das die Menschen in einer Art seelenlosen Zustand verbleiben lässt sowie Morde, bei denen das Innere der Opfer nach außen gekehrt wird. Ryō ermittelt in diesen Fällen, hüllt sich aber über seine Erkenntnisse, sowohl gegenüber seinen Untergebenen, als auch gegenüber seinen Brüdern, in Schweigen. Shin versteht die kühle ablehnende Haltung seines Bruders nicht, bis er eines Tages selbst in diese Vorfälle verwickelt wird und sein eigener „Persona“ erwacht.